I – Órgãos de Direção e Assessoramento Superior:
a) Secretaria Executivas;
b) Chefia de Gabinete;
c) Assessoria da Governança;
d) Assessoria de Comunicação;
e) Assessoria Técnica.
II – Órgãos de Apoio Administrativo:
a) Gerências:
Gerência Executiva Administrativa;
Gerência Executiva de Finanças e Contabilidade;
Gerência Executiva de Valorização de Pessoas;
Gerência de Irrigação;
Gerência de Política Agropecuária;
Gerência de Fortalecimento das Cadeias Produtivas;
Gerência de Políticas Públicas da Agricultura Familiar;
Gerência de Fortalecimento da Agricultura Familiar;
Gerência de Pesca;
Gerência de Apicultura.
III – Órgãos de Execução:
a) Superintendências:
Superintendência de Planejamento, Orçamento, Finanças e Contabilidade;
Superintendência de Irrigação e Unidades Avançadas;
Superintendência de Desenvolvimento Agropecuário;
Superintendência de Inclusão Produtiva;
Superintendência da Pesca;
Superintendência de Desenvolvimento da Aquicultura.
b) Chefias:
Chefia de Suprimentos
Chefia de Aquisição;
Chefia de Serviços Gerais;
Chefia de Manutenção Predial;
Chefia de Protocolo;
Chefia de Arquivo;
Chefia de Planejamento e Orçamento;
Chefia de Finanças e Contabilidade;
Chefia de Contas a Pagar;
Chefia de Controle de Processos;
Chefia de Movimentação e Benefícios;
Chefia de Capacitação;
Chefia de Integração Laboral;